Преподаватель ГУД Сергей Полуян на конгрессе «Суперкомпьютерные дни в России» рассказал о том, как при помощи численных методов проанализировать связи между белками.
Старший преподаватель кафедры распределенных информационно-вычислительных систем ИСАУ Сергей Полуян уже больше года занимается изучением вычислительных методов, упрощающих оценку взаимодействия белков между собой. На конгрессе в МГУ им. М.В. Ломоносова он представил доклад «Применение параллельных вычислений при реализации метода выборки переходных поверхностей», рассказав о том, как с помощью параллельных вычислений отслеживать процесс образования макромолекулярных комплексов вида «белок-белок»: это очень важно в работе медицинских химиков, биоинформатиков и биохимиков, при анализе поведения лекарств в организме.
В планах у научной группы, в которой Сергей Владимирович работает над этой темой, – разработать веб-сервис, который позволит специалистам из разных областей оценивать динамику процесса формирования белковых комплексов, загружая свои собственные структуры. Как отмечает Сергей Владимирович, главное преимущество метода – скорость: «В отличие от других численных или экспериментальных методов параллельные вычисления позволяют оценить динамику молекулярного комплекса в течение нескольких суток. В иных случаях результата придется ждать месяцы».
Работа над проектом ведется с использованием гетерогенной платформы «HybriLIT» Лаборатории информационных технологий ОИЯИ. Первые результаты исследования стали возможны благодаря предоставленным ресурсам и поддержке коллектива лаборатории.
Программный комитет рекомендовал работу Сергея Владимировича к публикации в журнале ВАК «Вычислительные методы и программирование».
В рамках конгресса «Суперкомпьютерные дни в России» ежегодно проходит конференция молодых ученых, где за лучшие работы участникам вручается Премия имени В.П. Гергеля. Как отмечает Сергей Владимирович, студенты выпускных курсов, чья тематика ВКР связана с суперкомпьютерными технологиями, большими данными, квантовыми вычислениями, ИИ, матмоделированием, системами хранения данных или сетевыми технологиями, могут принять участие в этой конференции и претендовать на получение премий в размере от 20 до 30 тыс. рублей.
Фото: Илья Долгопольский